Η Φιλοζωική από το 1997 έως και σήμερα, έχει συνεργαστεί με Δήμους και άλλους δημόσιους και ιδιωτικούς οργανισμούς, εφαρμόζοντας προγράμματα που περιλαμβάνουν περισυλλογή, στείρωση, εμβολιασμό, κτηνιατρική παρακολούθηση και εξετάσεις, έλεγχο λυσσύποπτων και επιθετικών αδέσποτων, σήμανση, ηλεκτρονική ταυτοποίηση για έλεγχο του πληθυσμού και επανατοποθέτηση των ζώων στο περιβάλλον τους.
